Il trattamento delle acque reflue può essere diviso in tre tipi: metodo fisico, metodo biologico e metodo chimico in base alla sua funzione.
1 Metodo fisico: l'azione fisica viene utilizzata principalmente per separare le sostanze insolubili nelle acque reflue e le proprietà chimiche non vengono modificate durante il trattamento. Comunemente usati sono la separazione della gravità, la separazione centrifuga, l'osmosi inversa, la galleggiamento dell'aria e simili. Il metodo fisico per il trattamento delle strutture è semplice ed economico e viene utilizzato nei casi in cui il volume dell'acqua di villaggi e città è grande, la capacità di auto-purificazione è forte e il grado di trattamento delle acque reflue non è elevato.
2 Metodo biologico: l'uso della funzione metabolica dei microrganismi, la materia organica disciolta o colloidale nelle acque reflue viene decomposta e ossidata in sostanze inorganiche stabili per purificare le acque reflue. Sono comunemente usati il metodo dei fanghi attivi e il metodo biofilm. Il grado di trattamento biologico è superiore a quello dei metodi fisici.
3 Metodo chimico: è un metodo per il trattamento o il recupero di sostanze disciolte o colloidali delle acque reflue per reazione chimica ed è principalmente utilizzato per le acque reflue industriali. Comunemente usati sono coagulazione, neutralizzazione, redox, scambio ionico e simili. Il metodo di trattamento chimico ha un buon effetto terapeutico e un costo elevato ed è principalmente utilizzato come effluente dopo il trattamento biochimico per un ulteriore trattamento per migliorare la qualità dell'acqua dell'effluente.